Oddělení aplikované biologie
Oddělení zahrnuje několik výzkumných směrů sdružující environmentální mikrobiologii,
vývoj a testování nanomateriálů pro biomedicínské aplikace.
Výzkum
Výzkumné směry v oddělení jsou zaměřeny zejména na:
Oddělení Aplikované biologie zahrnuje několik výzkumných směrů sdružujících environmentální mikrobiologii a vývoj nanomateriálů pro biomedicínské aplikace. Konkrétně se jedná o studium nanomateriálů a porézních struktur pro regenerativní medicínu, dopravu léčiv a kosmetiku; účinků nanomateriálů na přirozená mikrobiální společenstva, buněčné kultury in vitro a tkáňové modely ex vivo; aktivity mikroorganismů ve vztahu k bezpečnosti hlubinných geologických úložišť radioaktivního odpadu; antibakteriálních a algicidních vlastností nových fotokatalytických materiálů; vlivu sanačních zásahů na přírodní mikrobiální společenstva; a vývoj testovacích metodik a systémů pro hodnocení interakcí buněčných populací s (nano)materiály a aktivními látkami v simulovaných podmínkách.
Tým Oddělení aplikované biologie
RNDr. Alena Ševců Ph.D.
Mgr. Marie Czinnerová Ph.D.
Mgr. Huynh Anh Nhung Nguyen Ph.D.
Ing. Jakub Říha Ph.D.
Ing. Alice Břečková
Ing. Hana Tománková M.Sc.
Ing. Mgr. Karolína Morávková
Ing. Miroslava Rysová Ph.D.
Mgr. Kateřina Černá Ph.D.
Mgr. Kristýna Marková
Mgr. Veronika Hlaváčková PhD.
Mgr. Martin Pusztai Ph.D.
Publikace
- A Perspective on the Potential Impact of Microplastics and Nanoplastics on the Human Central Nervous SystemKimia Moiniafshari, Alessandra Zanut, Andrea Tapparo, Paolo Pastore, Sara Bogialli, Fazel Abdolahpur Monikh
- Acute toxicity of natural and synthetic clothing fibers towards Daphnia magna: Influence of fiber type and morphologyAndrew Barrick, Boardwine Boardwine, Huynh Anh Nhung Nguyen, Alena Ševců, Jana Novotná, Tham C. Hoang
- Dual acute effects of tire microplastics and their leachates on Spirodela polyrhiza and phyllosphere bacteriaDonia M. Osman, Wenke Yuan, Muthii Patrick Nyaga, Fazel Abdolahpur Monikh, Yuyi Yang
- Edible electrospun materials for scalable cultivated beef productionBenjamin A.S. Dagés, Jack A. Fabian, Miroslava Rysová, Paul Topham, Jean-Baptiste R.G. Souppez, Mariana Petronela Hanga, Eirini Theodosiou, Dagmar Poláková
- Effects of tire wear particles on freshwater bacterial-fungal community dynamics and subsequent elemental cycles using microcosmsYuanyuan Mo, Fazel Abdolahpur Monikh, Yousuf Dar Jaffer, Richard Mugani, Danny Ionescu, Guogui Chen, Jun Yang, Hans-Peter Grossart
Technologie
Přehled všech služeb, které oddělení nabízí:
Přehled služeb, které oddělení nabízí:
- Hodnocení antimikrobiálních vlastností fotokatalytických nátěrů (ISO 27447:2019, ISO 19635:2016)
- Hodnocení antimikrobiálních vlastností (nano)materiálů
- Hodnocení toxicity chemických látek (inhibice růstu řas a sinic) podle OECD Test No. 201
- Hodnocení bioremediačního potenciálu mikrobiálního společenstva na kontaminované lokalitě
- Hodnocení vlivu mikroorganismů na hlubinné úložiště radioaktivního odpadu,
- Hodnocení vlivu mikroorganismů na geologické úložiště vodíku
- Hodnocení vzniku mikrobiálně indukované koroze
- Hodnocení vlivu mikroorganismů na bentonitové bariéry skládek
- Akreditovaná analýza mikrobiálního znečištění povrchu fasád
Přehled služeb, které nabízí laboratoř Biomed:
- Hodnocení biokompatibility in vitro na savčích buňkách – Ověření biokompatibility makro/mikro/nanomateriálů v souladu s normou ISO 10993-5. Prováděno v přímém kontaktu/v nepřímém kontaktu (eluátu). Buněčný typ je možné volit dle očekávané expozice.
- Hodnocení kožní iritace a koroze in vitro – Hodnocení prováděno na rekonstruovaných kožních modelech dle OECD TG 439 (kožní iritace) a OECD TG 431 (kožní koroze). Posouzení je možné provádět u kapalných i pevných vzorků.
- Hodnocení oční iritace in vitro – Hodnocení bezpečností pro oční expozici. Prováděno na rekonstruovaných modelech rohovky EpiOcular™ dle OECD TG 492.
- Zakázkový vývoj a hodnocení biomateriálů – Vývoj a hodnocení biodegradabilních (nano)materiálů pro medicínské, kosmetické a potravinářské aplikace. Hodnocení z hlediska morfologie, vybraných chemických a užitných vlastností vč. biologických účinků, bezpečnosti vůči savčím buňkám (in vitro) a antibakteriální účinnosti (in vitro).
Přístroje
Kapacitu našich špičkových přístrojů můžete po dohodě využít i vy.
Ing.Kateřina Bobčíková,
E: katerina.bobcikova@tul.cz
Jedná se o fluorescenční mikroskop, kterým je možné analyzovat nativní preparáty v průchozím světle a analyzovat nativní i jiné vzorky s autofluorescencí nebo fluorescenčně barvené. Možnost snímání obrazu pomocí barevné kamery (AxioCam ICc 1) nebo černobílé kamery (AxioCam 705 mono). Vyhodnocování či úprava pořízených snímků se provádí v programu ZEN3.4 (blue edition).
RNDr.Alena Ševců, Ph.D.
T: +420 485 35 38 05
E: alena.sevcu@tul.cz
Sekvenování DNA
Ing.Kateřina Bobčíková,
E: katerina.bobcikova@tul.cz
Jedná se o materiálový mikroskop, kterým je možné analyzovat vzorky v odraženém světle, v temném či světlém poli s možností využití filtrů U-AN360 nebo U-PO3. Možnost snímání obrazu pomocí fotoaparátu Canon EOS 700D. Vyhodnocování či úprava pořízených snímků se provádí v programu QuickPHOTO MICRO 3.1
Mgr. Kristýna Marková
E: kristyna.markova2@tul.cz
Měření hladiny exprese genů z kolonie buněk či jedné buňky Detekce patogenů v krvi či reakcí buněk na určité typy léčiv
RNDr.Alena Ševců, Ph.D.
T: +420 485 35 38 05
E: alena.sevcu@tul.cz
Stanovení sekvence nukleotidů v molekulách nukleových kyselin
Ing.Hana Tománková, M.Sc.
T: +420 485 35 37 60
E: hana.tomankova@tul.cz
Destičkový spektrofotometr pro kvantifikaci molekul a analýzu biochemických dějů
Ing.Hana Tománková, M.Sc.
T: +420 485 35 37 60
E: hana.tomankova@tul.cz
Separace biomolekul s možností následné detekce a kvantifikace.
Mgr.Martin Pusztai, Ph.D.
T: +420 485 35 35 76
E: martin.pusztai@tul.cz
Analýza fyziologického stavu, případně kvantifikace, rostlin a jejich částí, lišejníků, řas či sinic na základě časově rozlišené fluorescence chlorofylu, a to v laboratoři i v terénu.
Ing.Miroslava Rysová, Ph.D.
E: miroslava.rysova@tul.cz
Hodnocení toxicity materálů in vitro v reálném čase
Bc.Alice Břečková
T: +420 485 35 38 17
E: alice.breckova@tul.cz
Jedná se o fluorescenční mikroskop využívaný zejména pro stanovení kvality pitných vod (stanovení biosestonu ČSN 75 7712 a stanovení abiosestonu ČSN 75 7713). Je jím možné analyzovat nativní preparáty v průchozím světle a nativní i jiné vzorky s autofluorescencí nebo fluorescenčně barvené. Možnost snímání obrazu pomocí barevné kamery Canon EOS 70D. Vyhodnocování či úprava pořízených snímků se provádí v programu QuickPHOTO MICRO 3.1
Ing.Miroslava Rysová, Ph.D.,
E: miroslava.rysova@tul.cz
Invertovaný fluorescenční mikroskop – analýza živých a fixovaných buněk
Ing.Hana Tománková, M.Sc.
T: +420 485 35 37 60
E: hana.tomankova@tul.cz
Dokumentační systém akrylamidových a agarózových gelů, blotovacích membrán (chemiluminiscence, fluorescence)
Ing. Hana Tománková, M.Sc.
E: hana.tomankova@tul.cz
Homgenizace vzorků o objemu do 50ml
Mgr.Veronika Hlaváčková, PhD.
T: +420 485 35 39 63
E: veronika.hlavackova@tul.cz
Anaerobní rukávový box Whitley se používá pro dlouhodobé udržení vzorků v anaerobní atmosféře s obsahem vodíku 5%. Je vhodný pro kultivace anaerobních mikroorganismů při laboratorních nebo zvýšených teplotách (do 58°C).
Ing.Kateřina Bobčíková
E: katerina.bobcikova@tul.cz
Fotoreaktor pro standardní testy fotokatalytické aktivity (ISO 27447:2019) a jiné fototokatalitické experimenty. Fotoreaktor umožňuje zapojení 1-10 zářivkek Philips TL 8W BLB G5 a desku nesoucí záživky je možné umístit do 12 poloh, čím je zajištěný rozsah intenzity záření od 50 do 1500µW/cm2. Polomatné sklo propouští UV-A záření s vrchní matnou stranou zajišťuje rovnoměrný rozptyl záření. Vzorky možné při experimentu orbitalově třepat nebo ponechat v klidu.
Mgr. Kristýna Marková
E: kristyna.markova2@tul.cz
PCR v reálném čase, slouží ke kvantifikaci cílové nukleové sekvence ve směsném vzorku.
Mgr. Kristýna Marková
E: kristyna.markova2@tul.cz
Digitální PCR, slouží k absolutní kvantifikaci cílové sekvence NK ve směsném vzorku
Mgr. Kristýna Marková
E: kristyna.markova2@tul.cz
Mikrofluidní elektroforéza pro analýzu nukleových kyselin
Mgr. Kristýna Marková
E: kristyna.markova2@tul.cz
Spertrofotomert na mikroobjemy k měření koncentrace a čistoty nukleových kyselin
Mgr. Kristýna Marková
E: kristyna.markova2@tul.cz
Fluoromert k měření koncentrace nukleových kyselin
Ústav pro nanomateriály, pokročilé technologie a inovace
Studentská 1402/2
sídlo:
Bendlova 1409/7 – budova L
460 01 Liberec 1
T +420 485 353 852
M +420 725 836 913
Zůstaňte v kontaktu
Designed with WordPress